Histórico

Histórico do Laboratório

                O Laboratório de Biomarcadores de Contaminação Aquática e Imunoquímica (LABCAI) foi fundado em 1997 pelos professores Dra Maria Risoleta Freire Marques e Dr. Afonso Celso Dias Bainy, ambos do Departamento de Bioquímica e Departamento de Aquicultura do Centro de Ciências Biológicas e Centro de Ciências Agrárias, respectivamente, da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC).

                O grupo tem atuação em diferentes áreas como ensino, pesquisa e extensão, onde tem sido desenvolvido trabalhos abordando respostas bioquímicas e moleculares de animais aquáticos frente a diferentes contaminantes ambientais. Dentre as diversas técnicas realizadas,  destacam-se: extração de RNA e DNA, hibridização subtrativa supressiva (SSH), PCR quantitativo em tempo real (qPCR), purificação de RNA mensageiro, eletroforese em gel de agarose, PCR em tempo real multiplex, transformação e clonagem gênica, sequenciamento, diagnóstico de doenças virais em camarão, ensaios enzimáticos, purificação de proteínas com cromatografia líquida de alta performance, expressão de proteínas , proteômica, western-blotting,  eletroforese em gel de poliacrilamida desnaturante e não-desnaturante.

                O LABCAI pertence à rede temática em conservação e recuperação de ecossistemas e remediação de áreas impactadas. Um dos projetos pioneiros realizados em 1996 consistiu na análise de defesas antioxidantes em mexilhões (Perna perna) e camarões (Penaeus paulensis). Nos anos seguintes foram realizados diversos trabalhos com a mesma espécie, onde foram avaliados biomarcadores bioquímicos indicadores de contaminação marinha. Logo após, verificou-se os efeitos da salinidade e contaminação ambiental em ostras Crassostrea rizhiophorae. Em paralelo, realizou-se a caracterização da atividade aglutinante da hemolinfa do peneídeo Penaeus paulensis (camarão-rosa) e a expressão das proteínas Hsp60 e Hsp70 no mexilhão Perna perna (Linné, 1758) no seu ambiente natural. Entre 2003 e 2005 foram avaliados os efeitos da salinidade sobre respostas bioquímicas de ostras (Crassostrea rhizophorae) expostas a óleo diesel, bem como, a avaliação de biomarcadores em Litopenaeus vannamei exposto a carbofuran. Em 2007, foram realizados  experimentos de expressão gênica com PXR, CYP3C1 e ABC5 em Danio rerio, seguido por clonagem e sequenciamento do receptor de vitamina D (VDR) em Poecilia vivipara.  Atualmente, as linhas de pesquisa desenvolvidas no laboratório abordam  a identificação e caracterização das diferentes isoformas do citocromo P450 em Crassostrea gigas e Crassostrea brasiliana, bem como o seu controle transcricional frente a exposição a contaminantes ambientais. Além disso, em muitos trabalhos verifica-se a atividade enzimática de enzimas antioxidantes e envolvidas no processo de biotransformação de xenobióticos em animais aquáticos. Recentemente, foram desenvolvidos projetos visando identificar e caracterizar a atividade de carboidrases  e  a avaliação de biomarcadores no camarão Litopenaeus vannamei e a análise de proteínas expressas diferencialmente em camarões Litopenaeus vannamei infectados pelo vírus da mancha branca apos exposição a permetrina por meio da técnica de proteômica.

                Em novembro de 2009, foi realizada a inauguração da nova instalação do LABCAI.  A solenidade contou com a presença de diversos representantes como o Ministro da Pesca e Aquicultura Altemie Gregolin, o então reitor da UFSC Álvaro Toubes Prata e o coordenador do Programa Tecnológico de Meio Ambiente (Proamb) da Petrobrás, Pedro Penido. O laboratório integra o projeto Redes Temáticas da Petrobrás, iniciativa em que entidades de ensino do país recebem apoio financeiro e de cooperação técnica por meio de parceria com o Centro de Pesquisas da Petrobras (Cenpes).

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History

The Laboratory for Biomarkers of Aquatic Contamination and Immunochemistry ( LABCAI ) was founded in 1997 by professors Dr. Maria Freire Risoleta Marques and Dr. Afonso Celso Dias Bainy , both of the Department of Biochemistry and Center Aquaculture Department of Biological Sciences and Center for Agricultural Sciences respectively , of the Federal University of Santa Catarina ( UFSC ) .

The group has operations in different areas such as teaching, research and extension , which has been developed works addressing molecular and biochemical responses of aquatic animals to different environmental contaminants . Among the various techniques used , include: extraction of RNA and DNA , suppressive subtractive hybridization ( SSH ) , real-time quantitative PCR ( qPCR ) , mRNA purification , agarose gel electrophoresis , multiplex real-time PCR , transformation and gene cloning , sequencing , diagnostics viral disease in shrimp, enzyme assays , protein purification with high performance liquid chromatography , protein expression, proteomics , western blotting , gel electrophoresis , non- denaturing polyacrylamide denaturing .

The LABCAI belongs to the thematic network on conservation and ecosystem restoration and remediation of impacted areas . One of the pioneering projects undertaken in 1996 was the analysis of antioxidant defenses in mussels ( Perna perna ) and shrimp ( Penaeus paulensis ) . In the following years several studies have been conducted with the same species , were evaluated biomarkers biochemical indicators of marine pollution . Soon after , there was the effect of environmental contamination and salinity in Crassostrea rizhiophorae . In parallel , we carried out the characterization of the binding activity of the hemolymph of Penaeus peneídeo paulensis ( pink shrimp ) and protein expression of Hsp60 and Hsp70 in the mussel Perna perna ( Linnaeus , 1758 ) in their natural environment . Between 2003 and 2005 we assessed the effects of salinity on biochemical responses of oysters ( Crassostrea rhizophorae ) exposed to diesel as well as the evaluation of biomarkers in Litopenaeus vannamei exposed to carbofuran . In 2007 , experiments were performed with gene expression PXR , CYP3C1 and ABC5 in Danio rerio , followed by cloning and sequencing of the vitamin D receptor ( VDR ) in Poecilia vivipara . Currently , the research lines developed in the laboratory address the identification and characterization of different isoforms of cytochrome P450 in Crassostrea gigas and Crassostrea brasiliana , and its transcriptional control against exposure to environmental contaminants . Furthermore , in many studies there is the activity of antioxidant enzymes and enzyme involved in the biotransformation of xenobiotics in aquatic animals . Recently, projects have been developed to identify and characterize the activity of carbohydrases and evaluation of biomarkers in Litopenaeus vannamei and analysis of differentially expressed proteins in shrimp Litopenaeus vannamei infected with white spot virus after exposure to permethrin through the technique of proteomics .

In November 2009 , it was held the inauguration of the new installation LABCAI . The ceremony was attended by many representatives as the Minister of Fisheries and Aquaculture Altemie Gregolin , then dean of the UFSC Álvaro Toubes Silver and coordinator of Environmental Technology ( Proamb ) Petrobras , Peter Penido . The laboratory is part of the Thematic Networks project Petrobras initiative in which educational institutions of the country receive financial and technical cooperation through partnership with the Petrobras Research Center ( Cenpes ) .